文章中心

了解、体验、感悟、分享——汇聚平台使用教程与科研动态。

云馆首页 资讯文章 新闻资讯 正文
新闻资讯

单细胞测序助力发现水仙环素:双靶点抑制VCAM-1/ICAM-1抗动脉粥样硬化

Genelibs文献解读 2026-09-21 01:31 289 次阅读
原文:Single-cell sequencing-guided discovery of narciclasine as a dual VCAM-1/ICAM-1 inhibitor for atherosclerosis management.
期刊:Genes & diseases(影响因子 9.4) |  PubMed | PMC 全文(含 PDF)

研究背景:动脉粥样硬化治疗仍缺“修复内皮”的良药

动脉粥样硬化(AS)是冠心病、心绞痛和缺血性心脏病的主要病理基础,全球每年约造成1760万例死亡。目前临床一线以他汀类等降脂药为主,虽能降低事件风险,却无法修复已受损的血管内皮细胞,且长期使用可能带来肝酶异常、肌毒性和糖尿病等副作用。AS早期,内皮细胞会通过上调细胞间黏附分子ICAM-1和血管细胞黏附分子VCAM-1,招募单核细胞进入动脉壁,推动脂质沉积与慢性炎症,最终形成易破裂斑块。因此,寻找能同时干预炎症黏附、保护内皮的新型药物,是该领域亟待突破的方向。

核心发现:水仙环素可同时靶向VCAM-1与ICAM-1

发表于《Genes & Diseases》(影响因子9.4)的这项研究,整合人类AS患者单细胞RNA测序数据、连通图(CMAP)药物筛选、网络药理学与机器学习,从天然化合物中鉴定出水仙环素(narciclasine)——一种来源于水仙属植物鳞茎、具有抗炎与抗肿瘤等活性的分子——作为抗AS候选药物。

研究团队分析GEO数据库中两个人类颈动脉斑块及邻近组织的scRNA-seq数据集(GSE155512、GSE159677),如图1所示,通过t-SNE聚类识别出21个细胞亚群,并注释出内皮细胞、巨噬细胞、血管平滑肌细胞、T细胞等类型;图2进一步展示斑块与邻近区域细胞间通讯网络的差异。差异表达分析(图3)发现,VCAM-1与ICAM-1是斑块区域多种细胞中共同上调的关键基因,也是水仙环素预测的核心靶点。

随后,分子对接、分子动力学模拟和表面等离子共振(SPR)实验证实,水仙环素与VCAM-1/ICAM-1具有强结合亲和力。在内皮细胞损伤模型及ApoE-/-动脉粥样硬化小鼠中,水仙环素显著下调VCAM-1/ICAM-1表达,缓解内皮功能障碍,并减少主动脉斑块负荷。

方法亮点:多组学+计算模拟+实验验证的闭环框架

该研究的方法学创新在于构建了“单细胞测序→CMAP药物重定位→网络药理学/机器学习预测靶点→计算模拟与SPR验证→细胞与动物实验”的完整流程。利用Seurat与Harmony处理数万个人类斑块单细胞数据,以CellChat解析细胞互作;再借公共数据库筛选疾病基因与药物靶点交集,锁定核心模块。这种多平台策略避免了单一方法的偏差,为复杂疾病的药物发现提供了可复用的稳健框架。

应用意义:从天然化合物到临床候选物的转化潜力

现有降脂方案难以逆转内皮损伤,而水仙环素通过双靶点抑制黏附分子,直击AS炎症与内皮招募环节。该研究不仅将水仙环素推向AS治疗候选药物的位置,也证明单细胞组学指导天然产物重定位的可行性。未来仍需临床研究验证其人体安全性与疗效,但这一成果为心血管药物研发开辟了新路径。

关键图表

Figure 1
Figure 1 Cell subpopulations in human carotid artery AS plaques and adjacent regions via scRNA-seq. (A) t-SNE plot showing 21 distinct cell clusters. (B) t-SNE plot depicting cell types enriched with specific marker genes. (C) He…
Figure 2
Figure 2 Cellular communication in adjacent and AS plaque regions. (A) Total number and intensity of interactions among different cell types in AS plaques and adjacent regions. (B) Network diagram illustrating changes in cell int…
Figure 3
Figure 3 DEGs in VSMCs, VECs, T cells, and macrophages in atherosclerotic plaque regions compared with adjacent regions. (A) GO molecular function and KEGG signaling pathway enrichment of upregulated genes in VECs in the atherosc…

本文图片转载自 PMC 开放获取全文,仅供学习参考,请以原文为准。

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 Genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。


商务邮箱

E-mail: [email protected]