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原文:Single-cell sequencing-guided discovery of narciclasine as a dual VCAM-1/ICAM-1 inhibitor for atherosclerosis management.
期刊:Genes & diseases(影响因子 9.4) | PubMed | PMC 全文(含 PDF)
动脉粥样硬化(AS)是冠心病、心绞痛和缺血性心脏病的主要病理基础,全球每年约造成1760万例死亡。目前临床一线以他汀类等降脂药为主,虽能降低事件风险,却无法修复已受损的血管内皮细胞,且长期使用可能带来肝酶异常、肌毒性和糖尿病等副作用。AS早期,内皮细胞会通过上调细胞间黏附分子ICAM-1和血管细胞黏附分子VCAM-1,招募单核细胞进入动脉壁,推动脂质沉积与慢性炎症,最终形成易破裂斑块。因此,寻找能同时干预炎症黏附、保护内皮的新型药物,是该领域亟待突破的方向。
发表于《Genes & Diseases》(影响因子9.4)的这项研究,整合人类AS患者单细胞RNA测序数据、连通图(CMAP)药物筛选、网络药理学与机器学习,从天然化合物中鉴定出水仙环素(narciclasine)——一种来源于水仙属植物鳞茎、具有抗炎与抗肿瘤等活性的分子——作为抗AS候选药物。
研究团队分析GEO数据库中两个人类颈动脉斑块及邻近组织的scRNA-seq数据集(GSE155512、GSE159677),如图1所示,通过t-SNE聚类识别出21个细胞亚群,并注释出内皮细胞、巨噬细胞、血管平滑肌细胞、T细胞等类型;图2进一步展示斑块与邻近区域细胞间通讯网络的差异。差异表达分析(图3)发现,VCAM-1与ICAM-1是斑块区域多种细胞中共同上调的关键基因,也是水仙环素预测的核心靶点。
随后,分子对接、分子动力学模拟和表面等离子共振(SPR)实验证实,水仙环素与VCAM-1/ICAM-1具有强结合亲和力。在内皮细胞损伤模型及ApoE-/-动脉粥样硬化小鼠中,水仙环素显著下调VCAM-1/ICAM-1表达,缓解内皮功能障碍,并减少主动脉斑块负荷。
该研究的方法学创新在于构建了“单细胞测序→CMAP药物重定位→网络药理学/机器学习预测靶点→计算模拟与SPR验证→细胞与动物实验”的完整流程。利用Seurat与Harmony处理数万个人类斑块单细胞数据,以CellChat解析细胞互作;再借公共数据库筛选疾病基因与药物靶点交集,锁定核心模块。这种多平台策略避免了单一方法的偏差,为复杂疾病的药物发现提供了可复用的稳健框架。
现有降脂方案难以逆转内皮损伤,而水仙环素通过双靶点抑制黏附分子,直击AS炎症与内皮招募环节。该研究不仅将水仙环素推向AS治疗候选药物的位置,也证明单细胞组学指导天然产物重定位的可行性。未来仍需临床研究验证其人体安全性与疗效,但这一成果为心血管药物研发开辟了新路径。



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